A venir
Appel à projets pour un accès financé à nos plateformes labélisées par le GIS IBiSA
31 mai 2024 (date limite de réponse) - GIS IBiSA - ProFi - FRISBI - FranceBioImaging
Les trois infrastructures nationales ProFi, FranceBioImaging et FRISBI et le GIS IBiSA lancent leur 3e appel pour financer votre accès aux plateformes. Les projets retenus bénéficieront d'un soutien jusqu'à 5000 € pour couvrir les frais d'utilisation de deux plateformes (ou plus !) labelisées IBISA.
Bonne nouvelle ! PLBS compte dans le domaine de l'imagerie, de la biologie structurale ou de la glyco-protéomique plusieurs plateformes labelisées par le GIS IBISA. Il s'agit d'ARIADNE, BICeL et PAGés-P3M.
Vous souhaitez travailler avec nous et d'autres plateformes des infrastructures ProFi, FranceBioImaging et FRISBI ? N'hésitez pas à répondre à cet appel à projets avant le 31 mai 2024.
Cycle de formations : Analyse de données de séquençage à haut-débit
6 et 7 Juin 2024 - Module 4: Analyses ChIP-seq
La plateforme Bilille propose en 2024 une nouvelle édition du cycle de formations "Analyse de données de séquençage à haut-débit", co-organisé par les services de formation du personnel de l’Université de Lille, du CNRS et de l’Inserm. Ce cycle est composé de 5 modules, à la carte.
Attention : les modules “Variants”, “Métagénomique” et “ChIP-seq” ne sont ouverts qu’une année sur deux:
- Module 1: Analyses ADN, 21 Février après-midi et 22 Février 2024 (1,5 jours) [fiche ]
- Module 2: Analyses de variants, du 08 au 10 Avril 2024 (2,5 jours) [fiche ]
- Module 3: Métagénomique (ouvert en 2025)
- Module 4: Analyses ChIP-seq, 6 et 7 Juin 2024 (2 jours) [fiche ]
- Module 5: Analyses RNA-seq, début d’année 2025 [inscriptions à l'automne 2024]
Les modules sont indépendants, seul le module 1 est un pré-requis pour les modules 2, 3, 4. Les séances sur ordinateurs se dérouleront avec Galaxy. Une formation d'une demi-journée sera proposée le 21 Février 2024 matin aux participants et participantes qui ne seraient pas familiers avec cet environnement web.
Toutes les informations avec le programme détaillé et les modalités d'inscription sont disponibles sur le site de la plateforme.
BICeL - Formation Analyse d'images, Fondamentaux IMAGE J/FIJI
6 et 7 juin 2024 - Campus Santé - Inserm Délégation Nord Ouest
Venez vous former à l'analyse d'images avec l'équipe du BioImaging Center Lille !
Public visé : Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Doctorants, Post-doctorants
Deux sessions : 21 et 22 MARS ou 6 et 7 JUIN 2024
Lieu : Salle informatique Sillage – 6 rue du Professeur Laguesse à Lille
Formation limitée à 10 personnes par session.
Modalité d'inscription via le service de formation continue de votre employeur. Plus d'informations.
Journée thématique "Stairway to High Content - Part 1: suspension cytometry"
13 juin 2024 - Campus Pasteur Lille, Institut de biologie de Lille
La Journée thématique "Stairway to High Content - Part 1: suspension cytometry" se déroulera à l'Institut Pasteur de Lille le jeudi 13 juin 2024.
Le but de cette journée est d'illustrer la complémentarité des techniques de cytométrie de masse et de cytométrie spectrale, articulées autour de pathologies du système nerveux central et de l'analyse de données high-content de cytométrie, avec un après-midi entièrement dédié à des tables rondes sur ces différentes approches.
Vous trouverez toutes les informations utiles sur le lien suivant : https://www.alphavisa.com/jtafc/2024/06/index.php
Evénements passés
Formation : Bases théoriques de cytométrie
19 avril 2024, de 9h à 12h - Campus Pasteur Lille
La prochaine formation théorique"cytométrie" proposée par le BICeL aura lieu le vendredi 19 avril 2024, de 9h à 12h en salle Citadelle du bâtiment Debeyre sur le Campus Pasteur Lille.
La cytométrie, quèsaco ? Une présentation accélérée par ici
Vous voulez en savoir plus ? Intéressé.e par cette formation ? N'hésitez pas à prendre contact avec nos ingénieurs !
Bilille & vous
9 avril à 14h, Siège de l'université de Lille, Rue Paul Duez à Lille
Comme chaque année, Bilille présente à ses utilisateurs un bilan de son activité de l'année passée et ses perspectives pour l'année à venir.
A cette occasion, la plateforme vous invite le 9 avril à 14h au siège de l'université de Lille (salle RDC-061, 42 rue Paul Duez, 59000 Lille). S'en suivra un café pour poursuivre les discussions.
Inscription https://framaforms.org/bilille-et-vous-9-avril-2024-a-14h00-1705514623
lien vers le site https://bilille.univ-lille.fr/events/details/bilille-vous-2024)
BICeL - Démo du système de super-résolution DeepSIM de CREST OPTICS
2 au 5 avril 2024 - Campus Pasteur Lille
Du 9 janvier matin au 12 janvier midi, le personnel de Nikon sera présent sur le campus Pasteur de Lille pour vous présenter et vous faire essayer le système de super-résolution DeepSIM de CREST OPTICS.
La super-résolution permet d’imager des structures <100nm sur échantillon cellulaire. La particularité du DeepSIM est la possibilité d’imager également des échantillons semi-épais (ex : organoïde, micro fluidique, organe sur puce, organes transparisé…). Autre avantage, la technologie DeepSIM est directement implémentable sur certains systèmes du BICeL.
Des créneaux de 1h30 vous sont proposés pour vous permettre de tester la technologie. La réservation s’effectue directement via le lien EVENTO
L'équipe du BICeL pourra vous conseiller sur les marquages à utiliser et vous accompagner sur une session de démonstration.
Webinar "IL1-12 and IL-23: paradoxical behavior in inflammation and cancer"
28 mars 2024, 12h30 - en visioconférence
Le jeudi 28/03 à 12h30 : Webinar "IL1-12 and IL-23: paradoxical behavior in inflammation and cancer" pour lequel nous aurons l'honneur d'accueillir le professeur Burkhard Becher de l'Université de Zurich. L'abstract et le lien de connexion sont sur l'affiche.
2e rencontres PLBS
26 mars, à partir de 9h - Campus Santé, UFR3S - Médecine, Pôle Recherche
PLBS invite les membres des unités de recherche utilisatrices de ses plateformes à une rencontre autour des développements méthodologiques et technologiques réalisés avec et pour eux !
Au cours de la matinée du 26 mars, vous aurez l'opportunité de découvrir les projets structurants du CPER 2021-2027 auxquels participent les plateformes et les réalisations de l'année écoulée. Des sessions posters permettront aux ingénieurs et techniciens des plateformes de vous présenter les équipements nouvellement arrivés et qui vous sont désormais accessibles. Plusieurs emplacements seront proposés pour les posters d'utilisateurs souhaitant partager leurs travaux ayant eu recours à au moins deux de nos plateformes.
Un buffet déjeunatoire sera servi entre 12h15 et 14h.
Au plaisir de vous rencontrer !
Retrouvez le programme ici
Inscription gratuite mais obligatoire ici
BICeL - Formation à la microscopie confocale
Mardi 19 Mars - visioconférence
Les membres du plateau de microscopie photonique du BICeL organisent une session de formation à la microscopie confocale le Mardi 19 Mars par visioconférence. Cette formation est proposée régulièrement aux personnes qui ont besoins d’utiliser prochainement et régulièrement les machines du BICeL.
L’objectif de la formation est de permettre aux nouveaux et futurs utilisateurs de la plateforme :
- d’acquérir et renforcer les connaissances de base en microscopie photonique et plus particulièrement en microscopie confocale
- de s’initier ou d’approfondir leur pratique de l’utilisation d’un microscope confocal.
Elle se déroulera en deux temps :
- Cours de 10h-12h30 : rappel sur la fluorescence et la préparation des échantillons biologiques vivants ou fixés, introduction à la microscopie confocal LSM et spinning disk.
- Travaux pratique 14h-16h : Initiation à l’utilisation d’un confocal LSM (Zeiss LSM880-Airyscan). L’objectif est de renforcer le lien entre théorie et applications.
Par la suite, pour les nouveaux utilisateurs n’ayant pas encore travaillés sur les systèmes du BICeL, une à deux sessions de pratique individuelle sur leurs échantillons est nécessaire pour valider la formation et permettre à l’utilisateur de travailler de manière autonome sur la prise d’images. Ces sessions pratique se déroulent sur le système le plus adapté à l’imagerie de l’échantillon après échange avec le personnel du BICeL.
Pour vous inscrire, merci de contacter directement le personnel référent de votre site :
- Sophie Salomé-Desnoulez pour le Campus Pasteur Lille
- Antonino Bongiovanni pour le Campus Santé
- Elodie Richard pour la Cité Scientifique
LiiFE - Séminaire technologique : Exploration comportementale
11 mars, à partir de 14h - Campus Santé, Pôle Recherche, Amphithéatre B (Aile Est, 3e étage)
LiiFE organise un workshop avec la société TSE systems pour la présentation de plusieurs systèmes d'étude comportementale, sur le campus Santé :
- Intellicage: grouped-housed behavioral and cognitive phenotyping
- Multiconditioning system: 10 behavioral conditionning paradigms in one
- NeuroLux: Integrating Wireless Optogenetics with In-Vivo Phenotyping Platforms
La participation à ce séminaire peut être comptabilisée pour votre formation continue en expérimentation animale.
Organisatrice : Charlotte Laloux, responsable du Plateau d'Exploration Fonctionnelle
PAGés-P3M - Enquête de satisfaction et recueil des besoins
Date limite de réponse : 8 mars 2024
PAGés vous propose de participer à une enquête visant à exprimer votre niveau de satisfaction et à orienter son catalogue de prestations pour vous accompagner dans vos prochains projets de recherche recourrant à l'analyse des glycannes, glycoconjugués et polysaccharides.
Répondre à l'enquête vous prendra de 5 à 10 minutes.
Votre participation est attendue jusqu'au 8 mars. Une première restitution sera proposée au cours des 2e rencontres PLBS, le 26 mars 2024.
Vous ne connaissez pas encore PAGés ? Faisons connaissance !
LiiFE - Séminaire technologique : Explorations fonctionnelle et comportementale
20 février, 9h30-11h30 - Campus Santé, Pôle Recherche de l'UFR3S, Salle du Conseil
LiiFE organise un séminaire technologique avec la société NOLDUS pour la présentation de plusieurs systèmes d'étude comportementale :
- Phenotyper : Cage modulable pour l'étude du comportement spontané sur plusieurs jours ou des comportements induits à court terme. Associé à des accessoires complémentaires (roue, feeder, leds, haut parleur, cognition wall, caméra HR), le phenotyper s'adapte à vos besoins specifiques.
- Module "External data" pour Ethovision XT : importer des données externes à vos fichiers de video-tracking (Enregistrement ultrasons, EEG, Live mouse tracker...)
- Module "Trial & hardware control" pour Ethovision XT : pour contrôler la diffusion de son, de lumière, de récompense, déclencher un enregistrement, gérer des accessoires de conditionnement...
- Modules "Sociability interaction" pour Ethovision XT : pour détecter et analyser les interactions entre 2 individus
- Autres systèmes: Catwalk, Erasmus Ladder, Daniovision (zebrafish)
Lieu : Campus Santé, Pôle Recherche de l'UFR3S, Salle du Conseil (RdC, Aile Est) - 1 place de verdun, Lille)
Organisatrice : Charlotte Laloux, responsable du Plateau d'Exploration Fonctionnelle
2023
LiiFE - Soutenance de thèse de doctorat
mardi 19 décembre, 13 h
Vincent ROCA soutiendra sa thèse de doctorat intitulée Harmonisation multicentrique d'images IRM du cerveau avec des modèles génératifs non-supervisés, le mardi 19 décembre à 13 h.
La soutenance pourra être suivie en ligne (code d'accès : 487891)
Le jury sera composé de :
- Renaud Lopes, directeur de thèse, maître de conférences des universités, praticien hospitalier, CHU de Lille
- Grégory Kuchcinski, co-encadrant de thèse, maître de conférences des universités, praticien hospitalier, CHU de Lille
- Jean-Pierre Pruvo, examinateur et Président du Jury, professeur des universités, praticien hospitalier, CHU de Lille
- Michel Dojat, rapporteur, directeur de recherche INSERM, Université Grenoble Alples
- Nicolas Menjot de Champfleur, rapporteur, professeur des universités, praticien hospitalier, CHU de Montpellier
- Christine Fernandez-Maloigne, examinatrice, professeur des universités, Université de Poitiers
SINBIOS lance son premier appel à soutien !
Date limite de réponse : 27 octobre 2023
SINBIOS est la 8e plateforme de PLBS. Crée en février 2022, elle offre aux unités de recherche en biologie et santé de la métropole lilloise un soutien informatique pour la Biologie dans les domaines suivants :
- la gestion des données de recherche, en termes de stockage, partage, conservation et sécurisation
- l’intégration logicielle avec l’étude, l’installation et la configuration de solutions logicielles et matérielles pour optimiser la collecte, le stockage et l'analyse de vos données de recherche
- la construction sur mesure d’espaces de travail collaboratif sécurisés pour vos projets de recherche
- le conseil dans le choix des technologies informatiques les plus appropriées pour vos activités de recherche
- l’aide à l'installation et la configuration des logiciels scientifiques disponibles sur les systèmes Linux, avec possibilité de formation ou transfert de compétences pour vos équipes
Vous avez un projet dans lequel vous pensez que SINBIOS peut vous accompagner ? N'hésitez pas à compléter un dossier avant le 27 octobre 2023.
Thermo Fisher Day - 70 ans de la découverte de l'ADN
12 octobre 2023, à partir de 9h - Campus Santé - Bât. Plateformes - Cancer
Pour fêter les 70 ans de la découverte de l'ADN, vous êtes invités au prochain Thermo Fisher Day sur le Campus Santé de l'Université de Lille, au Bâtiment Plateformes-Cancer.
Vous pourrez profiter d'une restauration sur place et également d'une animation inédite : présence toute la journée d'un caricaturiste !
BICeL - Formation : Approche théorique de l'analyse non-supervisée de données multidimensionnelles de cytométrie
11 octobre, 9h-12h - Campus Pasteur Lille, Amphithéâtre Buttiaux
L'analyse de données de cytométrie est le plus souvent réalisée manuellement (FlowJo, Cytobank, Diva...), mais des outils ont été développés afin de permettre une analyse non supervisée (réduction de dimension et clustering) et non biaisée. Ces outils se révèlent d'autant plus utiles que 1) les nombre de paramètres étudiés est élevé, le gating manuel bi-paramétrique "classique" étant d'autant plus fastidieux, subjectif, et non exhaustif, et 2) le nombre d'échantillons à analysé est grand.
Nous vous proposons une première approche théorique de ces outils et algorithmes le mercredi 11 octobre de 9h00 à 12h00 amphithéâtre Buttiaux de l'Institut Pasteur de Lille.
Inscription par simple retour de mail : olivier.molendi-costeinsermfr
GO@L-TAG - Microbiote : Métagénomique ciblée et les solutions d'analyse
5 juillet, 14h-17h30 - Séminaire en visioconférence
Le 5 juillet, le Cancéropôle Nord-Ouest organise une après-midi thématique en distanciel sur le thème "Cancer et fonctions cognitives : Axe Microbiote-Intestin-Cerveau" en distanciel.
A cette occasion, Ségolène Caboche, ingérieure de recherche sur la plateforme GO@L, assurera une présentation intitulée « Microbiote : Métagénomique ciblée et les solutions d'analyse ».
Inscription gratuite mais obligatoire avant le 4 juillet, 14h
BICeL - Formation théorique Cytométrie
2 juin 2023, 13h à 16h - Campus Pasteur Lille, Bâtiment Debeyre, salle Citadelle
La prochaine formation théorique à la cytométrie proposée par le plateau de cytométrie du BICeL aura lieu le vendredi 02 Juin de 13h à 16h en salle citadelle sur le Campus Pasteur Lille.
Cette formation est à destination des futurs utilisateurs du plateau de cytométrie que cela soit sur le Campus Pasteur Lille ou sur le Campus Santé.
Pour s'inscrire, contacter Olivier Molendi-Coste.
Rencontres PLBS
2 mai, à partir de 9h - Campus Pasteur Lille, amphi de l'Institut de Biologie de Lille
PLBS invite les membres des unités de recherche utilisatrices de ses plateformes à une rencontre autour des développements méthodologiques et technologiques réalisés avec et pour eux !
Au cours de la matinée du 2 mai, vous aurez l'opportunité de découvrir des projets réalisés sur les plateformes. Des sessions posters permettront aux ingénieurs et techniciens des plateformes de vous présenter les équipements nouvellement arrivés et qui vous sont désormais accessibles. Plusieurs emplacements seront proposés pour les posters d'utilisateurs souhaitant partager leurs travaux ayant eu recours à au moins deux de nos plateformes.
Un buffet déjeunatoire sera servi entre 12h30 et 14h.
Au plaisir de vous rencontrer !
Retrouvez le programme ici
Inscription gratuite mais obligatoire ici
Anniversaire du plateau de phénotypage métabolique de l'animalerie EOPS
3 avril 2023, à partir de 10h - Pôle Recherche de la Faculté de Médecine - Campus Santé
A l'occasion du 10e anniversaire du plateau de phénotypage métabolique de l'animalerie EOPS, Emilie Caron, ingénieure en responsabilité du plateau, vous propose de faire un bilan des réalisations de cette installation. En lien avec l'animalerie PHExMAR de la Cité scientifique, vous pourrez assister à une présentation de l'ensemble de l'offre en approche d'exploration métabolique de PLBS.
Nous vous donnons rendez-vous dans l'atrium du Pôle Recherche le 3 avril 2023 à 10h autour d'un buffet sucré et de posters illustrant les réalisations du plateau de phénotypage métabolique de la souris.
Les utilisateurs souhaitant présenter leurs travaux réalisés sur le plateau au cours de ces 10 années sont invités à nous adresser un poster pour le 27 mars 2023. PLBS assurera la prise en charge de l'impression.
La société Sable System, leader en terme de calorimétrie indirecte, vous présentera les dernières évolutions de leurs dispositifs exploratoires dans l'amphi B à partir de 11h.
Participation gratuite, inscription obligatoire ici.
Venez nombreux !
BICeL - Réunion annuelle des utilisateurs - Présentation du bilan et des activités
Jeudi 7 décembre 2023, 10h - Campus Santé, Pôle Recherche et visioconférence
Nous sommes ravis de convier les utilisateurs du BICeL sur les 3 campus lillois à la réunion annuelle du BICeL. Rejoignez-nous le jeudi 7 décembre 2023 à 10h pour une présentation complète du bilan et des activités !
Deux modalités :
- En visioconférence (code d'accès 735767)
- En présentiel : Amphi A de la Faculté de Médecine, Pôle Recherche. Ce sera l'occasion de rencontrer les ingénieurs et responsables des plateaux. Nous clôturerons la réunion par un moment de convivialité pour favoriser les échanges informels.
PLBS & Cie vous invitent au Musée pour la Fête de la Science 2023
7 et 8 octobre 2023 - Musée d'Histoire Naturelle de Lille
À l’occasion de la Fête de la science 2023, l’Université de Lille vous propose un parcours scientifique composé d’ateliers ludiques et pédagogiques autour de la thématique nationale : sport & science ! Ce parcours s'inscrit dans le Festival des sciences de l'Université de Lille et vous pourrez y retrouver 2 ateliers créés et animés par les chercheurs, ingénieurs et doctorants des plateformes et laboratoires lillois (PLBS, UGSF, UREPSSS) et l'ABL au Musée d’histoire naturelle de Lille, les 7 et 8 octobre !
L’entrée est gratuite, et on vous réserve de belles surprises. Donc que vous aimiez les belles maquettes animées, les gros microscopes, le sport, ou les dragibus, passez nous voir ce weekend !
bilille - Formation : Analyse de données de séquençage à haut-débit
2 au 6 octobre 2023 - Module 5 : Analyses RNA-seq
Bilille et les services formation des personnels de l'Inserm, du CNRS et de l'Université de Lille vous proposent tout au long de l'année 2023 un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.
Attention, à partir de 2023 les modules “Variants”, “Métagénomique” et “ChIP-seq” ne seront ouverts qu’un an sur deux :
- Module 1: Analyses ADN, 8 et 9 Mars 2023 (2 jours) [fiche]
- Module 2: Analyses de variants (ouvert en 2024)
- Module 3: Métagénomique, du 4 au 6 Avril 2023 (3 jours) [fiche]
- Module 4: Analyses ChIP-seq (ouvert en 2024)
- Module 5: Analyses RNA-seq, automne 2023 [fiche]
Toutes les informations avec le programme détaillé et les modalités d'inscription sont disponibles sur le site de la plateforme.
PAGés - Optimisation de la quantification des saccharides dérivés au TMS par GC-FID et performances du GC-FID d'Agilent
6 juillet 2023, 10h-10h30
PAGés a le plaisir de vous inviter à sa prochaine présentation qui se tiendra le jeudi 6 juillet de 10h à 10h30 via Zoom. Au cours de cette session, nous vous présenterons notre tout nouveau projet d'amélioration visant à optimiser la quantification des saccharides dérivés au TMS par GC-FID, ainsi que les performances du GC-FID d'Agilent.
Vous pouvez rejoindre la réunion Lien
BICeL - Design de panel en cytométrie spectrale
14 juin, 10h - Campus Santé, bâtiment Plateformes - Cancer
Le plateau de cytométrie est heureux de vous inviter à la présentation de la société thermofisher sur la thématique de la cytometrie spectrale. Vous pourrez aborder la stratégie du panel design en spectral et l'utilisation des nouveaux fluorochromes dans cette technologie pour faciliter vos détections antigéniques ou toutes autres questions concernant votre problèmatiques.
Nous vous donnons RDV le mercredi 14 juin à 10h dans le nouveau bâtiment plateformes - Cancer du Campus Santé.
L'inscription est gratuite mais obligatoire auprès de vos responsables de plateau :
olivier.molendi-costeinsermfr / Nathalie.jouyinsermfr / Emilie.floquetuniv-lillefr
LiiFE - How to improve your uncertainty estimates in deep models. Learning with limited supervision in the era of deep learning
Vendredi 26 mai à 9h30
La plateforme LiiFE vous invite à la présentation du Professeur José Dolz (ETS Montréal) intitulée “How to improve your uncertainty estimates in deep models. Learning with limited supervision in the era of deep learning”. Ce séminaire aura lieu le vendredi 26 mai à 9h30 :
-
en présentiel dans l’amphithéâtre de l’hôpital Roger Salengro (au niveau -2)
-
et en visio
Pour plus d'informations, contacter Romain Viard, ingénieur traitement du signal de LiiFE.
Appel à projets pour un accès financé à nos plateformes labélisées par le GIS IBiSA
21 avril 2023 (date limite de réponse) - GIS IBiSA - ProFi - FRISBI - FranceBioImaging
Les trois infrastructures nationales ProFi, FranceBioImaging et FRISBI ainsi que le GIS IBiSA lancent leur second appel pour un accès aux plateformes labelisées IBiSA, financé jusqu'à 5000 € pour couvrir vos frais d'utilisation de plateformes.
Bonne nouvelle ! PLBS compte dans le domaine de l'imagerie, de la biologie structurale ou de la glyco-protéomique 3 plateformes labelisées par le GIS IBISA. Vous souhaitez recourir à ARIADNE, BICeL ou PAGés-P3M ? N'hésitez pas à répondre à cet appel à projets avant le 21 avril 2023.
webinar du Groupe de Cytométrie de Masse de l'Association Française de Cytométrie
Vendredi 31 Mars à 12h
Le Groupe de Cytométrie de Masse de l'Association Française de Cytométrie vous propose un webinar le Vendredi 31 Mars à 12h00 portant sur l'analyse spatiale de la tumorigenèse des cancers colorectaux.
Nous aurons le plaisir d'accueillir le Dr. Jessica Roelands de l'Université de Leiden !
Toutes les infos sont disponibles ici
Connectez vous nombreux !
Zoom link : https://univ-amu-fr.zoom.us/j/88086594738?pwd=dzBVSEZieXpoL1IwNFNiQkp2U2RvQT09"
GO@L - Présentation des technologies transcriptomiques et protéomiques sous-cellulaires
17 mars 2023, 9h - En visioconférence
Nous avons le plaisir de vous inviter le 17 mars 2023 à la présentation de nouvelles technologies spatiales d’hybridation in-situ qui permettent d’identifier des milliers de transcrits ou protéines à l’échelle sous cellulaire. Dans le cadre d’un projet d’investissement CPER, nous souhaitons acquérir et donner accès à ces technologies à la communauté Lilloise au travers de PLBS.
JOLIBIO : JOurnée LIlloise de la BIOinformatique
9 novembre 2023, 9h00 à 17h00 - Espace Culture, Campus Cité Scientifique
La plateforme Bilille co-organise avec l'équipe de recherche Bonsai du CRiStAL, la première journée lilloise de la bioinformatique (JOLIBIO). Le but de cette journée est de favoriser les rencontres et les discussions entre acteurs et actrices de la bioinformatique, académiques ou industriels, en ingénierie ou en recherche.
PLBS & Cie vous invitent (aussi) au stade pour la Fête de la Science 2023 !
12 au 14 octobre 2023 - Stade G.Niquet à Marcq-en-Barœul
Cette édition de la Fête de la science propose de donner un éclairage sur des recherches en lien avec la mobilité sportive (mais pas exclusivement !)
Pour aborder ces questions, les chercheur·euse·s ont conçu des ateliers qui permettront d'échanger avec le public scolaire le jeudi et le vendredi, ainsi qu'avec tous les publics le samedi.
PLBS, l'UGSF et le LOG vous proposent de venir apprendre à nager comme un plancton !
Toutes les informations ici
Journée scientifique : Jumeaux numériques
6 juillet 2023, 13h45-17h30 - Campus Santé, Pôle Recherche, Amphi A
La plateforme Bilille co-organise avec l'unité de recherche METRICS une demi-journée scientifique sur le thème "jumeaux numériques" au pôle recherche de la faculté de médecine de Lille le 6 juillet 2023 après-midi.
BICeL - Formation Analyse d'images, Fondamentaux IMAGE J/FIJI
6 et 7 juillet 2023 - !!! SESSION SUPPLEMENTAIRE !!! - Campus Santé - Inserm Délégation Nord Ouest
Venez vous former à l'analyse d'images avec l'équipe du BioImaging Center Lille !
Public visé : Chercheurs, Ingénieurs, Techniciens, Doctorants, Post-doctorants
Dates : 3 sessions (9 et 10 mars, 4 et 5 mai ou 6 et 7 juillet 2023)
Lieu : Salle informatique Sillage – 6 rue du Professeur Laguesse à Lille
Formation limitée à 10 personnes par session.
Modalité d'inscription via le service de formation continue de votre employeur. Plus d'informations.
LiiFE reçoit Cyceron : Séminaire en imagerie in vivo et exploration fonctionnelle
19 juin 2023, de 14h à 18h30 - Campus Santé, Pôle Recherche, Amphi A
Le 19 juin de 14h à 18h30, la plateforme LiiFE de PLBS accueille la plateforme Cyceron de l’Université de Caen. LiiFE et Cyceron proposent l'intégration des modalités d’imagerie in vivo et des modèles expérimentaux permettant une meilleure compréhension de la physiologie et de la physiopathologie des maladies humaines.
Après une introduction des deux plateformes, l'après-midi du 19 juin se poursuivra avec une présentation de projets de recherche conduits avec LiiFE et Cyceron par les Unités de recherche.
Les communications orales se tiendront au pôle recherche du campus Santé dans l'amphi A.
Des posters seront également installés dans l'atrium. Si vous souhaitez présenter un poster de vos travaux réalisés avec LiiFE (imagerie pré-clinique, imagerie clinique ou exploration fonctionnelle et comportementale) ou avec Cyceron, n'hésitez pas à nous l'indiquer via le formulaire d'inscription.
Webinar CyTOF group France
7 juin 2023, 13h - wébinaire
Live-Cell Barcoding with Anti-CD45 Antibodies for Mass Cytometry
Pauline Maby, Immunomonitoring department, Pauli Calmettes Institute, Marseille
CyTOF group's webinar
2 mai 2023 à 16h
Le CyTOF group est heureux de vous inviter à son prochain webinar le 2 mai 2023 à 16h sur l’analyse de données IMC par John Lizhe Zhuang, département d’Oncologie de l’Université de Cambridge.
Enhanced single-cell segmentation and whole slide imaging analysis through dual-modality immunofluorescence and imaging mass cytometry (IMC)
BD - Deep science road-show
14 avril 2023, de 10h à 16h - Campus Pasteur Lille
Nous avons le plaisir de vous convier à une journée de conférences organisée avec la société Becton Dickinson intitulée "BD - Deep science road-show" qui traitera notamment des innovations en high-dimensional biologie, d'imagerie en cytométrie ainsi que de gestion de l'autofluorescence en cytométrie. Veuillez trouver le programme en pièce jointe.
Cette journée se déroulera le vendredi 14 Avril, de 10h à 16h00 à l’amphithéâtre Butiaux, Institut Pasteur de Lille.
L'inscription est gratuite mais obligatoire à l'adresse suivante : olivier.molendi-costeinsermfr
bilille & vous
21 mars 2023 - 14h - En visioconférence
bilille vous propose son rendez-vous annuel le mardi 21 mars à 14h00 afin de vous présenter le bilan de ses activités 2022 et ses perspectives pour 2023.
A cette occasion, nous invitons également Audrey Bihouée et Nadia Goué des plateformes de bioinformatique BiRD à Nantes et AuBI à Clermont-Ferrand, qui nous présenteront les activités et le fonctionnement de leurs plateformes respectives.
Merci de vous inscrire à ce rendez-vous via le site web de bilille
Evénement en visioconférence. Le lien de connexion sera communiqué la veille de l'événement.
Animaleries - Formation « Création et gestion de lignées murines génétiquement modifiées : actualités réglementaires et application des 3R »
3 février 2023 – Pôle Recherche de la Faculté de Médecine sur le Campus Santé de Lille
Intervenant : Karim Mesbah, Directeur opérationnel de plateau d'élevage et d'exploration fonctionnelle, Biocampus Montpellier et Expert scientifique Cellule AFiS du MESRI.
Public visé : Tout détenteur d'une certification de concepteur de projet ou applicateur de procédures expérimentales salariés ou étudiants de l'Université de Lille, CNRS, Inserm, Institut Pasteur de Lille et CHU de Lille
Lieu : Amphi B, Pôle Recherche de la Faculté de Médecine
Horaires : 9h-12h
Formation GRATUITE pour les personnels Université de Lille, CNRS, Inserm, Institut Pasteur de Lille et CHU de Lille.
Formation de 3h s'inscrivant dans le cadre de la formation continue obligatoire. Une attestation de formation sera délivrée à l'issue de la formation.
PLBS au Bar des Sciences
27 janvier 2023 - 12h15 - Cité scientifique de Villeneuve d'Ascq, LILLIAD
Venez vous étonner des super-propriétés de l’amidon avec Corentin Spriet, notre correspondant communication et médiation scientifique !
Le Bar des Sciences est un événement bi-mensuel, impulsé par la Faculté des Sciences et Technologies de l'Université de Lille.
Entrée libre et gratuite.
2022
Workshop nf-core
8-9 décembre 2022 - Cité scientifique de Villeneuve d'Ascq - bâtiment ESPRIT
Dans le cadre du réseau métier ingénieur.e.s lillois, bilille organise un workshop de 2 jours autour de la communauté internationale et des pipelines de bioinformatique nf-core, les 8 et 9 Décembre sur le campus Cité Scientifique de l’Université de Lille, à Villeneuve d’Ascq.
Inscription jusqu'au 14 novembre 2022 et informations sur la page de la journée
bilille - Appel à projets 2023
25 novembre 2022 - date limite d'envoi du formulaire de candidature
L'appel à projets 2023 de la plateforme de bioinformatique bilille est ouvert. Cet appel couvre la période janvier-décembre 2023 et concerne des missions ingénieurs de 1 à 3 mois, qui doivent relever du champ thématique de la plateforme : bioanalyse, bioinformatique, biostatistique. Il peut s'agir par exemple de test d'outils, d'analyse de données, de petits développements informatiques.
Ce service est pris en charge par la dotation allouée à PLBS (UAR 2014-US 41) par l’Université de Lille et est à ce titre sans frais pour les unités de recherche lilloises.
Cet appel à projets est ouvert aux seules unités de recherche lilloises.
Pour plus d'informations et pour accéder au formulaire de candidature
Journée scientifique conjointe LiiFE & bilille - ImAgerie & Intelligence Artificielle
16 novembre 2022 - Pôle Recherche de la Faculté de Médecine sur le Campus Santé de Lille
Depuis plus de 20 ans, l’intelligence artificielle démontre son efficacité dans de nombreuses applications notamment dans le domaine de la santé, plus récemment l’avènement du deep-learning a révolutionné à son tour le monde de l’imagerie médicale. C’est pourquoi les plateformes de bioinformatique bilille et d’imagerie LiiFE (Plateformes Lilloises en Biologie et Santé UAR 2014 – US 41) vous proposent une après-midi ouverte sur le thème ImAgerie & IA le 16 novembre 2022. Durant cette après-midi, 4 orateurs se succéderont afin d’aborder les méthodes et enjeux de l’IA illustrés par des applications en neuroradiologie et en radiothérapie. Organisée en présentiel au pôle recherche du campus Santé de Lille et retransmise par visioconférence.
Journée scientifique conjointe bilille & GO@L - Le RNA-seq, de la paillasse à l’analyse in-silico
28 juin 2022, dès 8h30 - Pôle Recherche de la Faculté de Médecine sur le Campus Santé de Lille
Cette journée vise à présenter un panel des développements récents autour de l’analyse des ARN, autant du point de vue des approches de biologie moléculaire que de l’analyse de données. Elle journée s’adresse à un public large allant des biologistes et médecins aux bioinformaticiens et biostatisticiens.
Nous espérons que le côté didactique de cette journée permettra à chacun de mesurer les enjeux et les limites de ces approches multi-disciplinaires.
Toutes les infos ici ! Inscription gratuite mais obligatoire
BICeL - Cytométrie - BD Innovation Tour
19 mai 2022 - Campus Pasteur Lille
Découvrez, Apprenez, Échangez avec les Spécialistes Applications de Becton Dickinson sur le thème du Tri Cellulaire.
Le plateau de cytométrie du BICeL vous invite le jeudi 19 mai 2022 à une journée organisée conjointement avec la société BD sur le thème du tri cellulaire.
BICeL - Présentation du trieur Bigfoot
31 mai 2022 - Bâtiment IRCL, Campus Santé de Lille
Rejoignez nous pour une présentation du trieur Bigfoot le 31/05/2022 au sous sol de l'IRCL.
Inscription obligatoire via le formulaire ci-joint
Fête de la Science - PLBS vous propose de voir le monde autrement !
6-9 octobre 2022 - Lille, la Halle aux sucres
Le réchauffement climatique a des causes et des conséquences que les chercheurs observent et quantifient quotidiennement grâce à différents outils tels que la microscopie optique, la fluorescence ou encore l’intelligence artificielle.
Après une présentation de ces outils développés par des chercheurs de la région, vous tenterez vous-mêmes de répondre à deux questions fondamentales de recherche que ces outils ont permis de traiter :
- Quel est l’impact de la pandémie de la COVID-19, en lien avec le réchauffement climatique, sur les organes d’un individu ?
- Comment imaginer les biomatériaux et les biocarburants de demain en étudiant la structure microscopique du bois ?
Glissez-vous dans la peau d’un chercheur pour voir le monde autrement !
Atelier sur réservation pour les scolaires. Entrée libre pour le grand public.
Plus d'informations et réservation : Les Sciences infusent
Les échappées inattendues - la science racontée par le CNRS
19 novembre 2022 - le 104 - Paris
Savez-vous que les expériences ne se vivent pas que dans les laboratoires ? « Les Échappées inattendues – la science racontée par le CNRS » le prouveront les 18 et 19 novembre au Centquatre, à Paris. Les scientifiques proposent aux visiteurs de découvrir leur univers au travers de récits, d’expériences immersives, d’ateliers et de démonstrations réalisées en direct. Le tout étant résolument ludique et accessible. Cet événement marque également le lancement d’un nouveau dispositif de médiation scientifique du CNRS qui sera ensuite déployé partout en France à partir de 2023.
Venez en particulier nous voir lors de la conférence démo: La patate à la rescousse de la méthode scientifique ! Samedi 19 novembre à 14h
Apprenez comment faire du plastique à partir de l’amidon des pommes de terre tout en adoptant la méthode scientifique : sa démarche et ses expérimentations, avec Xavier Roussel (UGSF) et Corentin Spriet (PLBS et UGSF).
Toutes les infos ici : https://echappeesinattendues.cnrs.fr/
ARIADNE-Criblage - 10ème Ecole Thématique de Criblage Bioscreen 2022
20 au 23 septembre 2022 - Le Valjoly
Cette école thématique récurrente sur le criblage moléculaire a l’ambition de regrouper des participants multidisciplinaires, académiques et industriels, afin de stimuler des échanges dans ce domaine. Cette manifestation sera l’occasion de former de nouveaux acteurs, mais également de présenter de nouvelles approches scientifiques et méthodologiques aux participants déjà expérimentés.
Les inscriptions sont ouvertes pour l’Ecole Thématique de Criblage 2022 qui aura lieu du mardi 20 au vendredi 23 septembre dans les Hauts-de-France. Cette formation est organisée par la plateforme de criblage ARIADNE et les chercheurs du réseau ChemBioScreen « Des petites molécules pour explorer le vivant ». Les informations et les liens d’inscription se trouvent sur le site de l’école.
bilille - Formation à l'analyse de données de séquençage à haut-débit
février à novembre 2022 - Cycle de formation
Bilille et les services formation de l'Inserm, CNRS, Université de Lille proposent en 2022 une nouvelle édition du cycle de formation "Analyse de données de séquençage à haut-débit". Ce cycle est composé de 5 modules, à la carte.
- Module 1: Analyses ADN, 23 et 24 février 2022 (2 jours)
- Module 2: Analyses de variants, du 28 au 30 mars 2022 (2,5 jours)
- Module 3: Métagénomique, du 17 au 19 mai 2022 (3 jours)
- Module 4: Analyses ChIP-seq, 14 et 15 juin 2022 (2 jours)
- Module 5: Analyses RNA-seq, automne 2022 [inscriptions en septembre 2022]
Tous les modules sont indépendants. Seul le contenu du module 1 est un pré-requis pour les modules 2, 3, 4.
Les séances sur ordinateurs se dérouleront avec Galaxy. Une formation d'une journée sera proposée le 22 février 2022 aux participants et participantes qui ne seraient pas familiers avec cet environnement web.
Toutes les informations avec le programme détaillé et les modalités d'inscription sont disponibles sur le site de la plateforme.
Le Labo - Cambrai reçoit le Festival du CNRS, et PLBS est de la partie !
13-15 octobre 2022
Pour sa deuxième édition, et à l’occasion de la Fête de la Science, le Festival du CNRS s’installe du 13 au 15 octobre au sein de l’établissement Le Labo - Cambrai. Au programme : trois jours d’ateliers et d’échanges avec des scientifiques des Hauts-de-France !
Et en bonus :
Un atelier Art & Science « Une aventure cellulaire pour une école inclusive et inventive ! » animé par des scientifiques des Plateformes Lilloises en Biologie et Santé PLBS (INSERM/ULille/CHU Lille/IPL/CNRS) et de l’Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UGSF (ULille/CNRS). Cet atelier invite le public à détourner des images de cellules microscopiques et à laisser libre cours à son imagination pour réaliser des productions artistiques.
Plus d’informations sur le Festival du CNRS en cliquant ici
N’hésitez pas à partager l’événement sur les réseaux sociaux : #FestivalCNRS #FDS2022
Les journées du 13 & 14 octobre sont consacrées aux établissements scolaires. La journée du 15 octobre est ouverte au grand public !
BICeL - Venez découvrir le trieur spectral AURORA CS et ses applications
4 juillet 2022, 14h - Bâtiment IRCL, Campus Santé de Lille
Venez découvrir l’innovation au service de vos projets scientifiques
Présentation de la cytométrie spectrale et du trieur Aurora Cell Sorter
- Présentation de nos panels multi-couleurs jusqu’à 5 Lasers
- Combinaison de fluorochromes à spectre d’émission proche (AF647/APC, BV421/PB, FITC/gfp…)
- Détection de petites particules (Violet-SSC)
- Extraction de l’autofluorescence
Pause Gourmande
Discussion autour de vos projets avec Olivier Jaen, ingénieur d’applications Cytek Biosciences
Journée scientifique bilille : Apprentissage pour l'intégration de données omiques
22 mars 2022 - Pôle Recherche de la Faculté de Médecine, Campus Santé
La plateforme bilille organise sa première journée scientifique de l'année le Mardi 22 Mars sur le thème "Apprentissage pour l'intégration de données omiques".
Cette journée se déroulera en présentiel sur le campus santé de Lille (Amphi B du pôle recherche) dès 10h.
La participation à cette journée est gratuite et ouverte à toutes et tous, mais l'inscription reste obligatoire (date limite pour s'inscrire le 14 Mars).
Le programme et l'inscription à cette journée s'effectue ici
BICeL - Séminaire & Workshop Leica
7 au 10 mars 2022 - Campus Pasteur Lille
Nous avons le plaisir de vous inviter à un évènement commun entre le BioImaging Center Lille BICeL et Leica, qui aura lieu à l’institut de Biologie de Lille du 07 au 10 mars 2022.
Lundi 7 mars 2022 à 13h - Séminaires Technologiques (Amphithéâtre de l’Institut de Biologie de Lille)
- BICeL : Présentation du BICeL et discussion (13h15-14h00)
- Leica : Présentation des ateliers et des systèmes disponibles (14h00-15h00)
- Catherine Daniel : « Persistence and dynamics of fluorescent Lacobacillus plantarum in the healthy versus inflamed gut » (15h15-15h45)
- Devrim Kilinc : « Studying the effects of BIN1 on amyloid plaques and microglia in clarified mouse brain » (15h45-16h15)
Mardi 8 au jeudi 7 mars 2022 - Ateliers/ Workshops (Rez-de-chaussée de l'Institut de Biologie de Lille)
Inscription nécessaire au préalable ou sur place le lundi 07/03, selon les disponibilités restantes.
Le nombre de places par ateliers sera limité afin de ne pas les surcharger et de respecter de bonnes conditions sanitaires. Les réservations aux ateliers pourront se faire sur les pages suivantes:
- Le microscope confocal Stellaris : https://doodle.com/poll/57gkqkc3r4hdtudb?utm_source=poll&utm_medium=link
- Thunder Imager 3D : https://doodle.com/poll/e6st8v4nzxdtiaac?utm_source=poll&utm_medium=link
bilille & vous
28 janvier 2022, 14h en visioconférence
Comme chaque année, bilille propose de faire un point sur ses activités de l'année passée et ses perspectives pour l'année à venir. A cette occasion, nous écouterons également Jacques van Helden, co-directeur de l'Institut Français de Bioinformatique, pour une présentation du projet d'EquipEx+ MuDiS4LS, porté par l'IFB et auquel bilille participe.
La réunion se déroulera en visioconférence via Zoom.
2021
BICeL - Séminaire & Workshop ZEISS
13 au 16 décembre 2021 - Campus Santé
Nous avons le plaisir de vous inviter à un évènement commun entre le BioImaging Center Lille BICeL et ZEISS, qui aura lieu au Pôle Recherche de la Faculté de Médecine de Lille du 13 au 16 décembre 2021. Toutes les infos ici:
Séminaire BICeL & Workshop ZEISS Du 13 au 16 décembre 2021
Séminaire technologique STED Mardi 16 Novembre 2021, 10h-12h
BICeL - Réunion des utilisateurs et utilisatrices
20 Septembre 2021, 10h-12h en visioconférence
Les plateaux de Microscopie Photonique, de Microscopie Electronique et de Cytométrie/Imagerie en flux des 3 campus du BICeL vous invitent à la réunion des utilisateurs.utilisatrices qui se tiendra le Lundi 20 Septembre 2021 de 10h à 12h en visioconférence.
Morgan Gautherot, doctorant de la plateforme LIIFE, vous invite à sa soutenance de thèse en neurosciences
13 décembre 2021 à 14h en visioconférence
Morgan est le premier doctorant de l'UMS PLBS à présenter les travaux qu'il a menés sous la direction de Renaud Lopes sur la plateforme LIIFE - Lille In Vivo Imaging and Functional Exploration.
Cette thèse a été réalisée sur le plateau clinique de la plateforme au sein du service de Neuroradiologie dirigé par Jean-Pierre Pruvo. Son travail est intitulé "L'âge cérébral estimé en IRM par apprentissage profond dans l'étude de la physiopathologie des maladies neurologiques et psychiatriques".
La soutenance de thèse aura lieu le 13 décembre, à partir de 14h dans l'amphi visio du Pôle Formation de la Faculté de Médecine.
Bilille lance son appel à projets 2022
1er décembre 2021 (date limite de réponse)
La plateforme bilille lance son “appel à projets” afin de recenser auprès des chercheurs en biologie et santé de la métropole lilloise les besoins en "moyens ingénieurs". Cet appel couvre la période de janvier à décembre 2022. Chaque mission peut durer de 1 à 3 mois, et doit relever du champ thématique de la plateforme: bioanalyse, bioinformatique, biostatistique. Il peut s'agir par exemple de test d'outils, d'analyse de données ou de petits développements informatiques.
Formulaire (date limite de retour 01/12/2021).
Plus d'informations sur le calendrier de cet appel et les missions de la plateforme https://wikis.univ-lille.fr/bilille/"