La plateforme offre son expertise en étude de faisabilité et en montage de projets d’analyse génomique pour des projets à moyen/haut débit. Elle propose la technologie de séquençage en adéquation avec le projet, sa complexité et en fonction du type d’échantillons. Avec une approche globale ou ciblée, elle assure le suivi et la réalisation des projets de recherche de la qualification des échantillons, de la préparation des librairies et de leurs séquençage, jusqu’à l’analyse bioinformatique et biostatistique de ces données. La plateforme développe son expertise sur les approches suivantes :

• Génomique : WGS, WES, amplicon-seq, LP/ULP-WGS, Méthylation

• Transcriptomique : RNA-seq, sRNA-seq, 3’RNA-seq, RNA-seq full length

• Single-cell : scRNA-seq, CITE-seq, transcriptomique spatiale

De la réalisation des expérimentations à l’accompagnement des équipes, la plateforme apporte son expertise sur le traitement des données générées :

• Caractérisation des génomes : détection de variants nucléotidiques, de structures, de la méthylation

• Analyse différentielle d’expression : contrôle qualité avancé, analyse non supervisée et supervisée, enrichissement des voies, identification de signatures

Pour en savoir plus, contactez nous: genomique-plbsuniv-lillefr