Le RNA-seq, de la paillasse à l’analyse in-silico
Lille, Mardi 28 Juin 2022

Cette journée vise à présenter un panel des développements récents autour de l’analyse des ARN, autant du point de vue des approches de biologie moléculaire que de l’analyse de données.

De ce fait, cette journée s’adresse à un public large allant des biologistes et médecins aux bioinformaticiens et biostatisticiens.

Nous espérons que le côté didactique de cette journée permettra à chacun de mesurer les enjeux et les limites de ces approches multi-disciplinaires.

Programme

  • 8h30-9h00: Accueil
  • 9h00-9h30: “Introduction au RNA-seq”, GO@L et Bilille
  • 9h30-10h20: "ARN non-codants et non-canoniques: approches sans référence", Daniel Gautheret (Université Paris-Saclay, I2BC)
  • 10h20-11h10: “Analyse épitranscriptomique des ARN par séquençage à haut-débit”, Virginie Marchand (Université de Lorraine, plateforme EpiRNA-Seq)
  • 11h10-11h40: Pause café
  • 11h40-12h30: "L'étude des interactions fonctionnelles au sein de l'holobionte par dual-RNAseq: apports et défis méthodologiques", Eve Toulza (Université de Perpignan, IHPE)
  • 12h30-14h: Pause déjeuner
  • 14h-14h50: "Identifying orthologous isoforms with conserved splicing structures", Samuel Blanquart (Inria Rennes-Bretagne Atlantique, IRISA)
  • 14h50-15h40: “Séquençage de l'ARN avec la technologie ONT”, Jean-Marc Aury (Université d’Evry, Génoscope)
  • 15h40-16h30: "Méta-analyse de données RNA-seq”, Guillemette Marot (Université de Lille, METRICS)

Inscription

L'inscription est gratuite, mais obligatoire à des fins logistiques. Elle comprend le café et le repas.

Les inscriptions sont maintenant closes

Cette inscription nous permettra également de vous communiquer d'éventuels compléments quant à l’organisation de cette journée.

Accès

La journée se tient au pôle recherche de la faculté de médecine (Point indicateur 8 du plan d'accès), salle des congrès (rez-de-chaussé du Pôle Recherche).

La station de métro la plus proche est 'CHU - Centre Oscar Lambret', sur la ligne 1.

Comité d'organisation

Martin Figeac (PLBS - Go@L), David Hot (PLBS - Go@L), Pierre Pericard (PLBS - bilille)

Soutien financier et remerciements

Cette journée est financée par l’UAR 2014 - US 41 Plateformes Lilloises en Biologie & Santé, France Génomique et l'Institut Français de Bioinformatique.

Nous remercions pour leur aide Estelle Chatelain, Sarah Guinchard, Frédéric Leprêtre, Corentin Spriet et Théodora Yaméogo-Goudjo.